Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
HIGD2AQ9BW72 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms