Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NUP58Q9BVL2 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms