Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF4Q9BUZ4 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF4Q9BUZ4 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF4Q9BUZ4 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF4Q9BUZ4 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF4Q9BUZ4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF4Q9BUZ4 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TRAF4Q9BUZ4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF4Q9BUZ4 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF4Q9BUZ4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF4Q9BUZ4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF4Q9BUZ4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF4Q9BUZ4 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF4Q9BUZ4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF4Q9BUZ4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF4Q9BUZ4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF4Q9BUZ4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF4Q9BUZ4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF4Q9BUZ4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF4Q9BUZ4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF4Q9BUZ4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF4Q9BUZ4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF4Q9BUZ4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF4Q9BUZ4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF4Q9BUZ4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF4Q9BUZ4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF4Q9BUZ4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF4Q9BUZ4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF4Q9BUZ4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF4Q9BUZ4 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF4Q9BUZ4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF4Q9BUZ4 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF4Q9BUZ4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TRAF4Q9BUZ4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF4Q9BUZ4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF4Q9BUZ4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF4Q9BUZ4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF4Q9BUZ4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF4Q9BUZ4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF4Q9BUZ4 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF4Q9BUZ4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF4Q9BUZ4 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF4Q9BUZ4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF4Q9BUZ4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF4Q9BUZ4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF4Q9BUZ4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF4Q9BUZ4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF4Q9BUZ4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF4Q9BUZ4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF4Q9BUZ4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF4Q9BUZ4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF4Q9BUZ4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF4Q9BUZ4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF4Q9BUZ4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF4Q9BUZ4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF4Q9BUZ4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TRAF4Q9BUZ4 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF4Q9BUZ4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF4Q9BUZ4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF4Q9BUZ4 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF4Q9BUZ4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF4Q9BUZ4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF4Q9BUZ4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF4Q9BUZ4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF4Q9BUZ4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF4Q9BUZ4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF4Q9BUZ4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF4Q9BUZ4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF4Q9BUZ4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF4Q9BUZ4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF4Q9BUZ4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF4Q9BUZ4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TRAF4Q9BUZ4 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRAF4Q9BUZ4 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRAF4Q9BUZ4 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRAF4Q9BUZ4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRAF4Q9BUZ4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRAF4Q9BUZ4 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRAF4Q9BUZ4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRAF4Q9BUZ4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRAF4Q9BUZ4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TRAF4Q9BUZ4 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF4Q9BUZ4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF4Q9BUZ4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF4Q9BUZ4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF4Q9BUZ4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF4Q9BUZ4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF4Q9BUZ4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF4Q9BUZ4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF4Q9BUZ4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF4Q9BUZ4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF4Q9BUZ4 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF4Q9BUZ4 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF4Q9BUZ4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF4Q9BUZ4 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF4Q9BUZ4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF4Q9BUZ4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF4Q9BUZ4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF4Q9BUZ4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TRAF4Q9BUZ4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms