Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
C9orf16Q9BUW7 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf16Q9BUW7 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms