Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU40

CHRDL1, Chordin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRDL1Q9BU40 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHRDL1Q9BU40 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CHRDL1Q9BU40 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms