Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RTKNQ9BST9 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RTKNQ9BST9 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RTKNQ9BST9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RTKNQ9BST9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
RTKNQ9BST9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RTKNQ9BST9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RTKNQ9BST9 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RTKNQ9BST9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RTKNQ9BST9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RTKNQ9BST9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RTKNQ9BST9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RTKNQ9BST9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RTKNQ9BST9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RTKNQ9BST9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RTKNQ9BST9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RTKNQ9BST9 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RTKNQ9BST9 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RTKNQ9BST9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RTKNQ9BST9 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RTKNQ9BST9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RTKNQ9BST9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RTKNQ9BST9 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RTKNQ9BST9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RTKNQ9BST9 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RTKNQ9BST9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RTKNQ9BST9 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RTKNQ9BST9 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RTKNQ9BST9 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RTKNQ9BST9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms