Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HERPUD2Q9BSE4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HERPUD2Q9BSE4 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms