Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GINS3Q9BRX5 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms