Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BPIFA3Q9BQP9 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms