Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
RETNLBQ9BQ08 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms