Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POP1Q99575 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POP1Q99575 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POP1Q99575 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POP1Q99575 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POP1Q99575 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POP1Q99575 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POP1Q99575 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POP1Q99575 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POP1Q99575 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POP1Q99575 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POP1Q99575 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POP1Q99575 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POP1Q99575 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POP1Q99575 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POP1Q99575 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POP1Q99575 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POP1Q99575 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POP1Q99575 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POP1Q99575 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POP1Q99575 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POP1Q99575 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POP1Q99575 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POP1Q99575 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
POP1Q99575 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
POP1Q99575 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POP1Q99575 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
POP1Q99575 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POP1Q99575 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POP1Q99575 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POP1Q99575 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POP1Q99575 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POP1Q99575 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POP1Q99575 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POP1Q99575 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POP1Q99575 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POP1Q99575 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POP1Q99575 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POP1Q99575 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
POP1Q99575 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POP1Q99575 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
POP1Q99575 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POP1Q99575 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
POP1Q99575 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
POP1Q99575 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POP1Q99575 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POP1Q99575 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POP1Q99575 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POP1Q99575 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POP1Q99575 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POP1Q99575 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POP1Q99575 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POP1Q99575 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POP1Q99575 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POP1Q99575 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POP1Q99575 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POP1Q99575 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POP1Q99575 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POP1Q99575 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POP1Q99575 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POP1Q99575 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POP1Q99575 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POP1Q99575 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POP1Q99575 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POP1Q99575 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POP1Q99575 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POP1Q99575 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
POP1Q99575 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POP1Q99575 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POP1Q99575 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
POP1Q99575 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
POP1Q99575 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POP1Q99575 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
POP1Q99575 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
POP1Q99575 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
POP1Q99575 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
POP1Q99575 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
POP1Q99575 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
POP1Q99575 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POP1Q99575 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POP1Q99575 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POP1Q99575 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POP1Q99575 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POP1Q99575 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POP1Q99575 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POP1Q99575 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POP1Q99575 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POP1Q99575 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POP1Q99575 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
POP1Q99575 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POP1Q99575 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POP1Q99575 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POP1Q99575 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POP1Q99575 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POP1Q99575 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POP1Q99575 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POP1Q99575 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
POP1Q99575 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POP1Q99575 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
POP1Q99575 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms