Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VAT1Q99536 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VAT1Q99536 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms