Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SIN3AQ96ST3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SIN3AQ96ST3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms