Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNFRSF13CQ96RJ3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNFRSF13CQ96RJ3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms