Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCDC85AQ96PX6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC85AQ96PX6 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms