Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL6

SCLT1, Sodium channel and clathrin linker 1, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCLT1Q96NL6 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SCLT1Q96NL6 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SCLT1Q96NL6 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SCLT1Q96NL6 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SCLT1Q96NL6 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCLT1Q96NL6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms