Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL0

RUNDC3B, RUN domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3BQ96NL0 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RUNDC3BQ96NL0 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RUNDC3BQ96NL0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms