Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
TSNARE1Q96NA8 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TSNARE1Q96NA8 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms