Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FGD4Q96M96 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms