Protein–RNA interactions for Protein: Q96JW4

SLC41A2, Solute carrier family 41 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A2Q96JW4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC41A2Q96JW4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC41A2Q96JW4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC41A2Q96JW4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC41A2Q96JW4 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC41A2Q96JW4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC41A2Q96JW4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC41A2Q96JW4 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC41A2Q96JW4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC41A2Q96JW4 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC41A2Q96JW4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC41A2Q96JW4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC41A2Q96JW4 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC41A2Q96JW4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC41A2Q96JW4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC41A2Q96JW4 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC41A2Q96JW4 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC41A2Q96JW4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC41A2Q96JW4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms