Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC136Q96JN2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC136Q96JN2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms