Protein–RNA interactions for Protein: Q96IT1

ZNF496, Zinc finger protein 496, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF496Q96IT1 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ZNF496Q96IT1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF496Q96IT1 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF496Q96IT1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF496Q96IT1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF496Q96IT1 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF496Q96IT1 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF496Q96IT1 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF496Q96IT1 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF496Q96IT1 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF496Q96IT1 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF496Q96IT1 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF496Q96IT1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF496Q96IT1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF496Q96IT1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF496Q96IT1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF496Q96IT1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF496Q96IT1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF496Q96IT1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF496Q96IT1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF496Q96IT1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF496Q96IT1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF496Q96IT1 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF496Q96IT1 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF496Q96IT1 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF496Q96IT1 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF496Q96IT1 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF496Q96IT1 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF496Q96IT1 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF496Q96IT1 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF496Q96IT1 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF496Q96IT1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF496Q96IT1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF496Q96IT1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF496Q96IT1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF496Q96IT1 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF496Q96IT1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF496Q96IT1 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF496Q96IT1 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF496Q96IT1 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF496Q96IT1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF496Q96IT1 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF496Q96IT1 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF496Q96IT1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF496Q96IT1 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF496Q96IT1 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms