Protein–RNA interactions for Protein: Q96I25

RBM17, Splicing factor 45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM17Q96I25 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RBM17Q96I25 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBM17Q96I25 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms