Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SCMH1Q96GD3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SCMH1Q96GD3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms