Protein–RNA interactions for Protein: Q96ER9

CCDC51, Coiled-coil domain-containing protein 51, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC51Q96ER9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC51Q96ER9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC51Q96ER9 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC51Q96ER9 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC51Q96ER9 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC51Q96ER9 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC51Q96ER9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC51Q96ER9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC51Q96ER9 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC51Q96ER9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC51Q96ER9 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC51Q96ER9 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC51Q96ER9 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC51Q96ER9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC51Q96ER9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC51Q96ER9 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC51Q96ER9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC51Q96ER9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC51Q96ER9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC51Q96ER9 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC51Q96ER9 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC51Q96ER9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC51Q96ER9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC51Q96ER9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC51Q96ER9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC51Q96ER9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC51Q96ER9 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC51Q96ER9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC51Q96ER9 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC51Q96ER9 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC51Q96ER9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC51Q96ER9 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC51Q96ER9 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC51Q96ER9 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC51Q96ER9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC51Q96ER9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC51Q96ER9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC51Q96ER9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC51Q96ER9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC51Q96ER9 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC51Q96ER9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC51Q96ER9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC51Q96ER9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC51Q96ER9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC51Q96ER9 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC51Q96ER9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC51Q96ER9 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC51Q96ER9 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC51Q96ER9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC51Q96ER9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC51Q96ER9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC51Q96ER9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC51Q96ER9 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC51Q96ER9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC51Q96ER9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC51Q96ER9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC51Q96ER9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC51Q96ER9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC51Q96ER9 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC51Q96ER9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC51Q96ER9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC51Q96ER9 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC51Q96ER9 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC51Q96ER9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC51Q96ER9 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC51Q96ER9 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC51Q96ER9 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC51Q96ER9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC51Q96ER9 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC51Q96ER9 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC51Q96ER9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC51Q96ER9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC51Q96ER9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC51Q96ER9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC51Q96ER9 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC51Q96ER9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC51Q96ER9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC51Q96ER9 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC51Q96ER9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC51Q96ER9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC51Q96ER9 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC51Q96ER9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC51Q96ER9 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC51Q96ER9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC51Q96ER9 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC51Q96ER9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC51Q96ER9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC51Q96ER9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC51Q96ER9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC51Q96ER9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC51Q96ER9 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC51Q96ER9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC51Q96ER9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC51Q96ER9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC51Q96ER9 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC51Q96ER9 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC51Q96ER9 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC51Q96ER9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC51Q96ER9 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC51Q96ER9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms