Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHFRQ96EP1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
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