Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB9

NSUN4, 5-methylcytosine rRNA methyltransferase NSUN4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN4Q96CB9 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSUN4Q96CB9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSUN4Q96CB9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms