Protein–RNA interactions for Protein: Q96BW1

UPRT, Uracil phosphoribosyltransferase homolog, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPRTQ96BW1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UPRTQ96BW1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms