Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TMIGD2Q96BF3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms