Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
UTP4Q969X6 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms