Protein–RNA interactions for Protein: Q92826

HOXB13, Homeobox protein Hox-B13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB13Q92826 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXB13Q92826 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms