Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ19

KCTD13, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD13Q8WZ19 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCTD13Q8WZ19 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KCTD13Q8WZ19 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KCTD13Q8WZ19 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KCTD13Q8WZ19 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KCTD13Q8WZ19 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCTD13Q8WZ19 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCTD13Q8WZ19 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCTD13Q8WZ19 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCTD13Q8WZ19 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCTD13Q8WZ19 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCTD13Q8WZ19 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCTD13Q8WZ19 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCTD13Q8WZ19 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCTD13Q8WZ19 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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