Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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COPS9Q8WXC6 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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COPS9Q8WXC6 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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COPS9Q8WXC6 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
COPS9Q8WXC6 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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