Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CCDC107Q8WV48 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC107Q8WV48 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC107Q8WV48 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC107Q8WV48 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CCDC107Q8WV48 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC107Q8WV48 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC107Q8WV48 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC107Q8WV48 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC107Q8WV48 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC107Q8WV48 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC107Q8WV48 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC107Q8WV48 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC107Q8WV48 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC107Q8WV48 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC107Q8WV48 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC107Q8WV48 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC107Q8WV48 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC107Q8WV48 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC107Q8WV48 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC107Q8WV48 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CCDC107Q8WV48 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms