Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
TRIM41Q8WV44 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TRIM41Q8WV44 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
TRIM41Q8WV44 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.75■■■□□ 2.99
TRIM41Q8WV44 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
TRIM41Q8WV44 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
TRIM41Q8WV44 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
TRIM41Q8WV44 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
TRIM41Q8WV44 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
TRIM41Q8WV44 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
TRIM41Q8WV44 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
TRIM41Q8WV44 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
TRIM41Q8WV44 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
TRIM41Q8WV44 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
TRIM41Q8WV44 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
TRIM41Q8WV44 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
TRIM41Q8WV44 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
TRIM41Q8WV44 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TRIM41Q8WV44 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TRIM41Q8WV44 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TRIM41Q8WV44 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
TRIM41Q8WV44 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
TRIM41Q8WV44 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TRIM41Q8WV44 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
TRIM41Q8WV44 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
TRIM41Q8WV44 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
TRIM41Q8WV44 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TRIM41Q8WV44 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
TRIM41Q8WV44 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TRIM41Q8WV44 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TRIM41Q8WV44 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
TRIM41Q8WV44 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
TRIM41Q8WV44 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TRIM41Q8WV44 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TRIM41Q8WV44 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
TRIM41Q8WV44 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
TRIM41Q8WV44 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
TRIM41Q8WV44 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TRIM41Q8WV44 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TRIM41Q8WV44 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
TRIM41Q8WV44 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
TRIM41Q8WV44 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
TRIM41Q8WV44 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
TRIM41Q8WV44 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
TRIM41Q8WV44 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
TRIM41Q8WV44 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
TRIM41Q8WV44 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
TRIM41Q8WV44 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
TRIM41Q8WV44 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
TRIM41Q8WV44 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
TRIM41Q8WV44 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
TRIM41Q8WV44 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
TRIM41Q8WV44 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
TRIM41Q8WV44 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
TRIM41Q8WV44 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
TRIM41Q8WV44 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC33.69■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC33.68■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC33.67■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC33.67■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.67■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
TRIM41Q8WV44 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms