Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
C17orf47Q8NEP4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms