Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPC24Q8NBT2 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPC24Q8NBT2 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPC24Q8NBT2 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPC24Q8NBT2 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPC24Q8NBT2 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPC24Q8NBT2 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPC24Q8NBT2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPC24Q8NBT2 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPC24Q8NBT2 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPC24Q8NBT2 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPC24Q8NBT2 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPC24Q8NBT2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPC24Q8NBT2 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPC24Q8NBT2 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPC24Q8NBT2 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPC24Q8NBT2 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPC24Q8NBT2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPC24Q8NBT2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPC24Q8NBT2 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPC24Q8NBT2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPC24Q8NBT2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPC24Q8NBT2 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPC24Q8NBT2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPC24Q8NBT2 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPC24Q8NBT2 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPC24Q8NBT2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPC24Q8NBT2 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPC24Q8NBT2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPC24Q8NBT2 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPC24Q8NBT2 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPC24Q8NBT2 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPC24Q8NBT2 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPC24Q8NBT2 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPC24Q8NBT2 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPC24Q8NBT2 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPC24Q8NBT2 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPC24Q8NBT2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPC24Q8NBT2 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPC24Q8NBT2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPC24Q8NBT2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPC24Q8NBT2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPC24Q8NBT2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SPC24Q8NBT2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPC24Q8NBT2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPC24Q8NBT2 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPC24Q8NBT2 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPC24Q8NBT2 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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