Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U6

LINC00518, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00518, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00518Q8N0U6 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
LINC00518Q8N0U6 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms