Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYU2

HACE1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, humanhuman

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1Q8IYU2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HACE1Q8IYU2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HACE1Q8IYU2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms