Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV32

CCDC71, Coiled-coil domain-containing protein 71, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71Q8IV32 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC71Q8IV32 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC71Q8IV32 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC71Q8IV32 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC71Q8IV32 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC71Q8IV32 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC71Q8IV32 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC71Q8IV32 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC71Q8IV32 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC71Q8IV32 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC71Q8IV32 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC71Q8IV32 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC71Q8IV32 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC71Q8IV32 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC71Q8IV32 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC71Q8IV32 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC71Q8IV32 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC71Q8IV32 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC71Q8IV32 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC71Q8IV32 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC71Q8IV32 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCDC71Q8IV32 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC71Q8IV32 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC71Q8IV32 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC71Q8IV32 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC71Q8IV32 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC71Q8IV32 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC71Q8IV32 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC71Q8IV32 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC71Q8IV32 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC71Q8IV32 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC71Q8IV32 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC71Q8IV32 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC71Q8IV32 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC71Q8IV32 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC71Q8IV32 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC71Q8IV32 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC71Q8IV32 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCDC71Q8IV32 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms