Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUD2

ERC1, ELKS/Rab6-interacting/CAST family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERC1Q8IUD2 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERC1Q8IUD2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERC1Q8IUD2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERC1Q8IUD2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERC1Q8IUD2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERC1Q8IUD2 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERC1Q8IUD2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERC1Q8IUD2 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERC1Q8IUD2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERC1Q8IUD2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERC1Q8IUD2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERC1Q8IUD2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERC1Q8IUD2 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERC1Q8IUD2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ERC1Q8IUD2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERC1Q8IUD2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERC1Q8IUD2 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERC1Q8IUD2 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERC1Q8IUD2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERC1Q8IUD2 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERC1Q8IUD2 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERC1Q8IUD2 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERC1Q8IUD2 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERC1Q8IUD2 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERC1Q8IUD2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERC1Q8IUD2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERC1Q8IUD2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERC1Q8IUD2 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERC1Q8IUD2 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERC1Q8IUD2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERC1Q8IUD2 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERC1Q8IUD2 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERC1Q8IUD2 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERC1Q8IUD2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERC1Q8IUD2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERC1Q8IUD2 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERC1Q8IUD2 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERC1Q8IUD2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERC1Q8IUD2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERC1Q8IUD2 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ERC1Q8IUD2 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERC1Q8IUD2 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERC1Q8IUD2 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERC1Q8IUD2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERC1Q8IUD2 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERC1Q8IUD2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERC1Q8IUD2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERC1Q8IUD2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERC1Q8IUD2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERC1Q8IUD2 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERC1Q8IUD2 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERC1Q8IUD2 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERC1Q8IUD2 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERC1Q8IUD2 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERC1Q8IUD2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERC1Q8IUD2 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERC1Q8IUD2 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERC1Q8IUD2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERC1Q8IUD2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERC1Q8IUD2 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERC1Q8IUD2 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ERC1Q8IUD2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERC1Q8IUD2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERC1Q8IUD2 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERC1Q8IUD2 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERC1Q8IUD2 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERC1Q8IUD2 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERC1Q8IUD2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERC1Q8IUD2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERC1Q8IUD2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERC1Q8IUD2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ERC1Q8IUD2 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ERC1Q8IUD2 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ERC1Q8IUD2 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERC1Q8IUD2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERC1Q8IUD2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERC1Q8IUD2 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERC1Q8IUD2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERC1Q8IUD2 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERC1Q8IUD2 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ERC1Q8IUD2 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERC1Q8IUD2 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ERC1Q8IUD2 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERC1Q8IUD2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERC1Q8IUD2 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERC1Q8IUD2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERC1Q8IUD2 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERC1Q8IUD2 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERC1Q8IUD2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERC1Q8IUD2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERC1Q8IUD2 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERC1Q8IUD2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERC1Q8IUD2 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERC1Q8IUD2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERC1Q8IUD2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERC1Q8IUD2 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERC1Q8IUD2 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERC1Q8IUD2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERC1Q8IUD2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERC1Q8IUD2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms