Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW6

N4BP2, NEDD4-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP2Q86UW6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
N4BP2Q86UW6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
N4BP2Q86UW6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
N4BP2Q86UW6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
N4BP2Q86UW6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
N4BP2Q86UW6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
N4BP2Q86UW6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
N4BP2Q86UW6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
N4BP2Q86UW6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
N4BP2Q86UW6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
N4BP2Q86UW6 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
N4BP2Q86UW6 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
N4BP2Q86UW6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
N4BP2Q86UW6 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
N4BP2Q86UW6 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
N4BP2Q86UW6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
N4BP2Q86UW6 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
N4BP2Q86UW6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
N4BP2Q86UW6 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
N4BP2Q86UW6 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
N4BP2Q86UW6 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
N4BP2Q86UW6 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
N4BP2Q86UW6 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
N4BP2Q86UW6 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
N4BP2Q86UW6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
N4BP2Q86UW6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
N4BP2Q86UW6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
N4BP2Q86UW6 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
N4BP2Q86UW6 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
N4BP2Q86UW6 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
N4BP2Q86UW6 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
N4BP2Q86UW6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
N4BP2Q86UW6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
N4BP2Q86UW6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
N4BP2Q86UW6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
N4BP2Q86UW6 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
N4BP2Q86UW6 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
N4BP2Q86UW6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
N4BP2Q86UW6 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
N4BP2Q86UW6 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
N4BP2Q86UW6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
N4BP2Q86UW6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
N4BP2Q86UW6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
N4BP2Q86UW6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
N4BP2Q86UW6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
N4BP2Q86UW6 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
N4BP2Q86UW6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
N4BP2Q86UW6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
N4BP2Q86UW6 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
N4BP2Q86UW6 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
N4BP2Q86UW6 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
N4BP2Q86UW6 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
N4BP2Q86UW6 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
N4BP2Q86UW6 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
N4BP2Q86UW6 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
N4BP2Q86UW6 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
N4BP2Q86UW6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
N4BP2Q86UW6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
N4BP2Q86UW6 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
N4BP2Q86UW6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
N4BP2Q86UW6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms