Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SYDE1Q6ZW31 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SYDE1Q6ZW31 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms