Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT89

SLC25A48, Solute carrier family 25 member 48, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A48Q6ZT89 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SLC25A48Q6ZT89 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms