Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQX7

LIAT1, Protein LIAT1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIAT1Q6ZQX7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 AKR1B10P2-201ENST00000577332 927 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LIAT1Q6ZQX7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LIAT1Q6ZQX7 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms