Protein–RNA interactions for Protein: Q6U736

OPN5, Opsin-5, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN5Q6U736 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
OPN5Q6U736 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OPN5Q6U736 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OPN5Q6U736 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OPN5Q6U736 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
OPN5Q6U736 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OPN5Q6U736 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
OPN5Q6U736 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
OPN5Q6U736 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
OPN5Q6U736 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
OPN5Q6U736 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
OPN5Q6U736 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OPN5Q6U736 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OPN5Q6U736 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OPN5Q6U736 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OPN5Q6U736 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
OPN5Q6U736 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OPN5Q6U736 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OPN5Q6U736 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
OPN5Q6U736 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OPN5Q6U736 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
OPN5Q6U736 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OPN5Q6U736 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OPN5Q6U736 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OPN5Q6U736 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OPN5Q6U736 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OPN5Q6U736 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OPN5Q6U736 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OPN5Q6U736 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OPN5Q6U736 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OPN5Q6U736 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OPN5Q6U736 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OPN5Q6U736 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OPN5Q6U736 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OPN5Q6U736 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OPN5Q6U736 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
OPN5Q6U736 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
OPN5Q6U736 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OPN5Q6U736 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OPN5Q6U736 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OPN5Q6U736 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OPN5Q6U736 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OPN5Q6U736 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OPN5Q6U736 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OPN5Q6U736 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OPN5Q6U736 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OPN5Q6U736 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OPN5Q6U736 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OPN5Q6U736 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OPN5Q6U736 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OPN5Q6U736 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OPN5Q6U736 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OPN5Q6U736 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OPN5Q6U736 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OPN5Q6U736 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OPN5Q6U736 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OPN5Q6U736 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OPN5Q6U736 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OPN5Q6U736 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
OPN5Q6U736 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OPN5Q6U736 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OPN5Q6U736 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OPN5Q6U736 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OPN5Q6U736 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OPN5Q6U736 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms