Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5L8

SHC4, SHC-transforming protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC4Q6S5L8 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHC4Q6S5L8 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHC4Q6S5L8 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SHC4Q6S5L8 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHC4Q6S5L8 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHC4Q6S5L8 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHC4Q6S5L8 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SHC4Q6S5L8 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SHC4Q6S5L8 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SHC4Q6S5L8 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHC4Q6S5L8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms