Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC137Q6PK04 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms