Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCD5

RFWD3, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFWD3Q6PCD5 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFWD3Q6PCD5 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms