Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB7

SLC27A1, Long-chain fatty acid transport protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A1Q6PCB7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC27A1Q6PCB7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms